霉菌是一种微生物，在自然界中广泛存在。霉菌从气体、液态物质、固体物质中提取能量和营养，遍布在各种生物体表面、地表、水中、废弃物堆积物中、纺织物上、墙壁上等等，不同的霉菌对生长环境的要求不同，一些霉菌仅在特定的生存环境中生长。
霉菌在生态系统中起着至关重要的作用。一方面，霉菌作为分解生物质的微生物之一，能将生物体中的碳、氮等元素释放出来，这对土壤中的植物生长至关重要；另一方面，霉菌分泌出一些物质，如抗生素、酶、色素等，对医学、食品、环保等领域有重要意义。
但同时，也有一些霉菌受等不利的影响。例如洞穴中的霉菌能造成岩壁和地质物体的侵蚀，久置在建筑物内的湿木材中的霉菌则会导致木材腐烂，构成安全隐患。